... можешь пояснить более подробно чем тебя напрягает наличие Armature? это не файл, это блок данных, его наличие не делает проект критичным в каком-либо отношении ...
>> то эта анимация в юнити работает по другому,... можешь показать fbx, который загрузаешь в blender и fbx, который экспортируешь в юни? ...