Привет! Не знаю, то ли нужно было andrey, но этот плагин позволяет создать группу вершин, которая получается в месте вычитания. Там Блендер сам создаёт при булевых операциях какие-то непонятно зачем группы. Чтоб не заблудиться. группа называется "Difference"
Помещаем аддон в нужную папку, находим его под именем "Boolean Apply" во вкладке "MESH", подключаем и после этого появится кнопка "Apply boolean" на Т-панели во вкладке "Misc". Я бываю только по выходным тут, так что, тестируйте.
