Вообще, триангулированные модели проще выкинуть и смоделить заново, чем как то их редактировать.
Но конкретно в этом случае могу посоветовать ровнять не луп толсом, а масштабированием по нормали.
Ставим ориентацию осей "нормаль", центр трансформации "активный элемент"
Выделяем все треугольники которые должны быть в одной плоскости, последним выделяем тот треугольник который лежит в нужной плоскости.
Жмакаем S Z 0, все выделенные треугольники встают в плоскость активного треугольника.
Конкретно по твоим выделенным треугольникам. Вот два треугольника выровнены, выделяем следующие два, последним тот что граничит с ровными, Жмакаем S Z 0, получаем углы по рёбрам помеченным у тебя жёлтым 0,00, угол по ребру межу этими парами как был так и остаётся 4,695.
Правда дальняя вершина последнего треугольника уйдёт с оси симметрии, чтоб этого не произошло можно попробовать у последней пары треугольников повернуть диагональ, тогда уйдёт внешняя вершина.