>>... но возможно есть способы не допускать их появления при моделировании, то есть опиши процесс их образования ...
внешние стенки не утапливаются вниз, а дублируются, ребра при этом тоже не объединяются
в SketсhUp к примеру такой способ прекрасно работает
Я в таких случаях потом всегда руками исправлял.
... если сцена настроена (это окружение, свет и т.п.), то наверное нужно только добавить из другой проги объект и настроить его материал ...Спасибо! Сохранить отдельным слоем и через obj перекинуть в Blender.